碱基序列怎么写_育才学习网

碱基突变怎么写

1.紫外线诱导碱基突变的机制是怎样的

紫外线的致突变作用紫外线（ultraviolet light,UV）能使DNA产生很多光生成物。有两种不同的光生成物，一种发生在相邻的两个嘧啶之间——环丁烷嘧啶光二聚体，另一种是6-4光生成物。其中胸腺嘧啶二聚体是重要的一种损伤。

实验证明，经UV照射的胸腺嘧啶溶液的吸收光谱与原来不一样。说明它的结构已发生变化。经分析测定，它们已变成胸腺嘧啶二聚体。当UV照射后，先是两个胸腺嘧啶的双链变成单链，然后两个胸腺嘧啶分子连接起来，形成一个胸腺嘧啶二聚体。

胸腺嘧啶二聚体通常发生在同一DNA链上两个相邻的胸腺嘧啶之间，也可以发生在两个单链之间，这种二聚体是很稳定的。如果它发生在两链之间，就会由于它的交联而阻碍双链的分开，从而影响复制；如果它发生在同一链的两个相邻胸腺嘧啶之间，就会阻碍腺嘌呤A的正常掺入作用，复制时就会在此处突然停止，并随意掺入别的碱基，结果在新合成的链上的碱基顺序发生了改变，因而引起突变。紫外线引起的突变包括各种形式的转换和颠换。

在二聚体的3'端插入一个错误碱基，通常的二聚体为5'-CC-3'和5'-TC-3'，所以C→T转换最为常见。

紫外线还能引起缺失、重复和移码突变。这些突变可能是紫外线的直接作用、间接作用和SOS系统共同作用的结果。

SOS修复系统有诱变作用。当E.coli中的RecA蛋白发生改变时，能使细菌细胞出现SOS反应，同时也发生各种转换和颠换，但以G-C→T-A颠换为多，而且有序列优先性，如在CGA序列中的G→T颠换率是在AGA或GGA序列中的20倍以上。已知在E.coli中SOS系统的诱变作用除了与recA有十分重要关系外，与umnC、umuD基因的关系也十分密切。umuC突变使SOS系统的诱变作用丧失，因此umnC基因产物很可能是错误潜伏修复系统的重要组成部分。SOS系统的诱变作用的另一种可能途径是RecA蛋白促进了不完全同源的DNA序列之间的重组，产生大量的错配碱基，从而引起突变。

2.请问,用perl语言如何将DNA序列中的任意碱基突变,随机产生20条突

我先给你说个原理，首先读取序列，以$seq为例，然后取int rand(length($seq)）即是你要突变的随机位点号；然后可以随机取$mutation=int rand(4)；这里要看你的具体处理情况了，你是容忍A突变成A呢，还是必须选一个不一样的来突变。如果必须不一样的话，你也可以选int rand(3)，这样取的是0,1,2，然后分别对应另外3个碱基。这样的突变是等概率的，你也可以根据自己的原理来修改。

至于怎么由随机数生成碱基，可以写个函数，然后用if完成，这是最简单的方法了。

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